重複するんだが、pthread の入れ替え後、mysqld がクラッシュするというエラーログは出力されなくなった。かなり安定したようだ。
それと eAccelerator を止めたせいか、nucleus の各テーブルに対して myisamchk を実行したとき closed されてない、といったメッセージが表示されることが少なくなった。以前はいろんなテーブルが closed されてないよ、と出てたんだが今は nucleus_plugin_counter と nucleus_plugin_view の２つのみ。しかも flush tables を実行するとちゃんと同期されるようで、直後に myisamchk を実行するとエラー表示はされなくなる。

ところで、スクリプト終了時に mysql へのコネクションは自動で閉じられるはずで、nucleus のソースでも、念のため、というコードも仕込まれていて、そこで何か echo するとブラウザに表示されてることから、ちゃんとそこの終了処理ルーチンは通ってる様子。だけど何故か前述の２つのテーブルは closed にならないことが多い。

とはいえ、mysql コマンドで nucleus 用のデータベースを選択して、flush tables を実行すると、上記２つのテーブルもきちんと closed になるようなので、そんなに気にする必要ないのかも...というかここんところちょっと立て込んでるのであまり詳しく調べてられないので、ほったらかしというのが本当のところ。